炼金术是一门科学，其基础是等价交换原则。它可以将物质进行分析、重组，实现一种物品转化为另一种物品的过程。然而，炼金术严禁进行人体炼成，这是绝对的禁忌。然而，拥有极高炼金术天赋的爱德华和阿尔冯斯兄弟，为了弥补对母亲的思念，无视了这一禁忌。最终，代价是爱德华失去了一条手臂和一条腿，而阿尔冯斯的灵魂只能寄宿在一副巨大的装甲中。为了恢复原状，兄弟俩寻求更多的炼金术知识，成为国家炼金术师，并踏上了寻找终极炼金物品——贤者之石的旅程。在不断摸索中，他们终于揭示了贤者之石背后的真相，对所处的军事化国家有了更深入的了解。此时，面对国家、民族、家庭等等，炼金术的未来究竟在何方？
