故事旁白由雷克斯·路瑟开始，描述了超人作为一个地球上的英雄所做的壮举和形象。雷克斯形容超人就像是地球上的一位神祇，但他坚持说“即使是神，也必须在该来的时候死去”。露易丝·莲恩和超人正在浪漫的约会，但露易丝对他们的关系安排并不满意。超人认为他们的关系只能在孤立堡垒中秘密度过。他还没有向她透露他真实身份是克拉克·肯特，尽管露易丝已经开始怀疑。 与此同时，雷克斯公司的挖掘队发现了一艘太空船，而在工人们进行挖掘时，不小心释放了经基因改造的凶残怪物末日杀手。末日杀手杀死了所有的工人，然后来到城市，一路上杀死了鹿、狗和狗的主人。末日杀手肆无忌惮地到达大都市后，与超人展开了一场大战。最后，超人全力抓住它，从高空直落撞击地面。露易丝和同事吉米·奥尔森报告说超人已经成功击败了敌人，但也因伤势过重而死亡。世界集体悼念这位倒下的英雄，并在公园里建立了超人的纪念碑。之后，雷克斯杀死了他的女助手，以确保没有人知道雷克斯公司和末日杀手的出现有关。随后，吉米对超人的死感到非常悲伤，意外地到了另一家大型报社上班。超人死后，犯罪率上升，玩具人操控着巨大的机械蜘蛛，并挟持一辆装满孩子的校车停在屋顶上。露易丝决定解救人质，独自前往。然而，在遇到危机时，超人意外地及时出现，制服了玩具人。露易丝高兴地与复活的超人亲吻，之后超人的养母玛莎质疑为什么他没有给家里打电话，露易丝也觉得超人的行为有些奇怪。然后揭示，实际上复活的超人是雷克斯制造的克隆人。雷克斯在超人与末日杀手的战斗中收集了超人的血液，因此克隆超人只听从雷克斯的命令。雷克斯将克隆超人引到一个有红色太阳光的房间，并戴上氪石手套不断打击他，以发泄自己的愤怒。打完后，雷克斯前去看他私自挖出的超人本尊尸体。但实际上，超人仍然活着，并被超人的机器人助手悄悄地移到了孤立堡垒中恢复力量。复制超人在看到逃狱后的玩具人杀死了一名4岁女孩的报道时，性格突然变得阴暗，立即前去杀掉玩具人。这个行为让周围的人感到奇怪，警察也开始追捕他，露易丝认为他不是真正的超人。露易丝和吉米发现了雷克斯想要复制超人的计划，当雷克斯正计划解决两人时，复制超人突然出现帮助了他们，并将所有的克隆超人试管全部摧毁。复制超人自己取出体内含铅的氪石，使得雷克斯无法控制他。另一方面，真正的超人在机器人助手的帮助下逐渐恢复力量。但听到有关克隆超人与步队交战的消息后，他立即前往。然而，他的力量只恢复了六成，机器人给他穿上了黑色的太阳超人装，并将氪石枪交给了他。之后，超人与克隆超人展开了一场激战，超人的氪石枪被打飞到远处，超人一直处于下风。露易丝捡起氪石枪计划射击克隆超人，但枪被对方损坏，不过氪石罐掉了出来。克隆超人在与超人的战斗中将纪念碑举起，试图结束对方，超人用热力射线击碎了黏在克隆超人胸口的氪石罐，释放出大量的氪气。克隆超人因此失败。临死前，他告诉超人要保护人民。露易丝确认他是真正的超人，并亲吻了他，同时也赢得了大家的信任。超人来到露易丝的公寓，发现她的文章“复活”拼写错误，并戴上眼镜证明自己就是克拉克。露易丝兴奋地拥抱他。在雷克斯公司，雷克斯先前被复制超人重伤，但仍然活着。他微笑着思考，历史证明，神祇可以死亡，但他们也可以从死亡中复活。他可能再次考虑如何摧毁超人。