在一个美丽如画的英国乡村中，生活着一位自然学家名叫查尔斯·达尔文（由保罗·贝坦尼饰演）。他与妻子和女儿过着宁静的生活。达尔文的大女儿安妮（由一位十岁的女孩饰演）对世界充满好奇，因此他经常教导她关于自然和科学的知识，包括他的进化论理论。然而，在那个时代，人们普遍相信上帝是宇宙的创造者，所以安妮口中的进化论理论被视为危险的，甚至导致她被家庭教师体罚。就连达尔文深爱的妻子艾玛（由詹妮弗·康纳利饰演）也无法接受他的观点和研究。更加令达尔文痛苦的是，不久之后，小安妮因病去世，这个支撑他完成学说的力量也消失了，整理《物种起源》手稿的任务变得异常艰难。这部电影改编自达尔文的第三代玄孙兰德尔·凯恩斯的传记小说《安妮的盒子》。
