公元2035年,人类遭受了一种由12只猴子军研制的病毒的侵袭,导致大部分人类在这场病毒灾害中丧生。只有少数幸存者能够在地下藏身,艰难地维持着生存。为了追查12只猴子军的起源,科学家们决定派遣志愿者穿越时间回到1996年。而被选中的志愿者正是囚徒詹姆斯·科尔。然而,由于一系列巧合,科尔穿越的时间点却是1990年。当他试图向当时的人们描述未来的大灾难时,他被误认为是精神病患,被医生凯瑟琳·雪莉诊断为精神分裂症。在病友杰弗里·戈因斯的帮助下,科尔成功逃脱并返回了未来。由于未能查明12只猴子军的起源,科尔再次被派回到1996年。这次,科尔发现12只猴子军的起源地在费城,并找到了凯瑟琳医生。两人一起展开了追查12只猴子军的冒险之旅。他们穿越时空,揭开了12只猴子军的来历,并努力寻找解决这场病毒灾害的方法。