1964年，美国纽约布朗克斯区的圣尼古拉斯天主学校，有两位教职员工备受学生们关注。一位是修女阿洛伊修斯·贝维尔，她以严厉的教条和禁止令而闻名，学生们对她敬畏有加。另一位是新来的神父布伦丹·弗林，他态度友善、开明，深受学生们的喜爱。在学校中，弗林特别关心一位名叫唐纳德·米勒的黑人学生，他是学校历史上的第一位黑人学生。弗林对唐纳德格外照顾，给予他鼓励和支持。某天，学生詹姆斯修女向贝维尔修女举报了唐纳德的奇怪行为。贝维尔修女听后认定弗林与唐纳德之间存在不正当的关系，她决定不惜一切代价禁止这种情况的发生。然而，真相究竟如何呢？故事将会揭示出更多的细节。