经过数百万年的进化，熊猫一族经历了无数艰难困苦，走到了今天。虽然濒临灭绝的熊猫得到了人类的细心保护，但是一场前所未有的灾难即将席卷它们的家园，狂风暴雨将会引发洪水，威胁着熊猫一族的生存。为了担心后代的命运，祖先们向熊猫菩萨（赵忠祥配音）请教，菩萨预言将会有一只继承了祖先们智慧的超级熊猫降生，拯救本族的命运。与此同时，森林中名叫潘迪（何炅配音）的小熊猫出生了，他还不知道自己肩负的使命。淘气捣蛋的潘迪惹出了不少麻烦，也经历了许多考验，同时结交了许多好朋友。在祖先之一（李扬配音）的引导下，潘迪逐渐承担起本族未来的重任……