《川西剿匪记》是一部讲述了新中国身世的故事。故事发生在川西烟道要塞两河口，主要讲述了青年周致斌和江湖戏班女子丹凤之间的爱恨情仇。周致斌是一个血性青年，与丹凤在万年台上飞刀定情。然而，周致斌的父亲周文轩也爱上了丹凤。一纸禁烟令将两河口卷入了争夺烟道的战斗。周致斌与镇长之子张济邦、两河孤儿黄登宝成为兄弟，誓死守卫两河口。为了救丹凤，他们多次勇闯匪窝，却被大土匪金刚钻活捉。黄登宝投奔金刚钻成为他的得力悍将，张济邦被恶人陷害被送到省城的军校念书，而周致斌则被打成瘸子。为了保住周致斌的性命，丹凤嫁给了周文轩。然而，周文轩在官匪勾结中被害身亡，周致斌和丹凤也遭到了世人的唾弃。丹凤撑起了周家，周致斌离开两河口投奔张济邦。周致斌沾染上烟土，被人打得七零八落送回两河口。小人李耀武借机羞辱周致斌，丹凤用周家的宅券换回了周致斌的性命。周致斌来到省城的军校，得知张济邦已被枪毙。姜维淑将周致斌救回茅草屋，周致斌终于觉悟了自己的责任。他为了给父亲报仇，大开杀戒。丹凤帮助周致斌戒掉大烟，让他娶下姜维淑。周致斌和黄登宝联手杀死金刚钻，周致斌成为两河口镇镇长，黄登宝成为烟道上最大的匪首。共产党禁烟剿匪的消息传入两河口，黄登宝离开两河口加入黄埔军校。周致斌创造了儿子周维的身世之谜，与丹凤和姜维淑发生了矛盾。丹凤决定抱走周维，让周致斌和姜维淑过上幸福的生活。丹凤离开后，周致斌认下周维，过上了平静的日子。张济邦成为解放军连长，黄登宝成为百姓党特派员，两人重回两河口。周致斌担心张济邦会夺走自己的家庭，拒绝与共产党合作。黄登宝挑拨离间，使周致斌与张济邦渐行渐远。丹凤得知两河口不安定的消息，回到周府。周致斌担心张济邦和姜维淑的关系，与黄登宝发生冲突。丹凤炸开通往两河口的门路，用自己的生命唱出了最后的挽歌。周致斌最终站到了正义的一方，与张济邦、姜维淑一起迎来了新中国的成功。