以悟觉僧人为首的少林十八棍僧接到皇上的御诏，奉命南下抗击倭寇。在江浙前线，棍僧们救下了一队被倭寇追杀的百姓。不料，倭寇首领的亲弟弟被棍僧所杀，引发了一场激烈的战斗。为了保护百姓的安全，棍僧们带领难民前往飞鱼隘口，希望能够得到明军的支援。然而，他们却发现飞鱼隘口的明军早已撤离，只好在此暂时休整。不久后，倭寇派出主力步队攻打飞鱼隘口。土城中只有一些老弱妇孺，棍僧们决定留下来帮助村民抵抗倭寇。在生死关头，十八棍僧配合默契，成功抵挡了倭寇的进攻。然而，由于师弟情绪激动，几位师兄弟不幸被倭寇杀害。倭寇首领得知土城中有少林的僧人，派出了忍者步队进行偷袭，准备发动最后的决战，以报弟弟之仇并霸占飞鱼隘口。为了保护百姓的安全，棍僧们决定牺牲自己，摆出了坚固的棍阵，用肉身挡住了倭寇的猛烈攻势。最终，他们成功让黎民们脱离危险，但自己也为此付出了巨大的代价。